《云南农业大学学报》（双月刊）创刊于1986年，是由云南省教育厅主管，云南农业大学主办。1986年创刊时为半年刊，1989年改为季刊，2004年改为双月刊。本刊是面向国内外公开发行的学术研究刊物，是中文核心期刊、中国科技核心期刊、中国农业科学核心期刊。主要刊登生物技术和农业生物多样性研究、作物遗传育种研究、植物保护、土壤科学、园艺与食品科学、动物科学、农业生态与环境科学、农业工程等领域以第一手资料撰写的学术论文、研究报告、研究简报等。为完全开放存取期刊，建有独立网站和全文数据库。本刊网站具有“作者在线投稿”、“专家在线审稿”、“作者在线查询”、“远程编辑”和“在线订阅”等功能。目前从收稿、审稿到修改稿均在线传送，大部分编辑流程在网上进行。此外，向读者提供最新录用、现刊题录和摘要、过刊的全文(PDF格式)，并提供全文免费检索服务等功能。

《云南农业大学学报》1989年获云南省高等学校自然科学优秀学报编辑质量一等奖； 1990年获全国高等学校自然科学优秀学报编辑质量二等奖；1992年获全国高等农业院校学报编辑质量二等奖；1995年获全国高等农业院校优秀学报一等奖；1999年获全国高等学校自然科学优秀学报二等奖；2004年获全国高等学校优秀学术期刊二等奖； 2004年被国家科技部评定为中国科技核心期刊；2006年中国农业科学核心期刊；2006年云南省优秀学术期刊二等奖；2006年云南省优秀期刊装帧奖；2007年云南省期刊质量评估为A类期刊。